不同單細胞全基因組擴增體系擴增牛微量血液DNA效果評價

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摘 要：  旨在通過二代測序技術評估不同單細胞全基因組擴增（single cell whole genome amplification， scWGA）體系對牛微量血液基因組DNA的擴增效果，建立微量DNA全基因組擴增體系。本研究分別采用MDA（multiple displacement amplification）和MALBAC（multiple annealing and looping-based amplification cycles）兩種scWGA體系對華西牛1 ng血液基因組DNA進行全基因組擴增，隨后基于兩種體系的擴增產(chǎn)物以及原始未稀釋血液DNA構建測序文庫，利用DNBSEQ-T7RS測序平臺進行全基因組測序（whole genome sequencing，WGS），通過比較擴增產(chǎn)物片段大小、濃度、總質量評估擴增效率，通過分析GC含量、測序覆蓋度、基因分型一致率、基因型檢出率等評估兩種體系的擴增效果。（剩余18648字）