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木豆OFP蛋白基因家族鑒定與表達(dá)分析

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摘要:了解OFP卵型家族蛋白(OVATE family proteins)在木豆中的特征,為木豆OFP基因的應(yīng)用提供參考。利用生物信息學(xué)方法對(duì)木豆OFP蛋白基因進(jìn)行全基因組鑒定及表達(dá)模式分析。結(jié)果表明,木豆含有21個(gè)OFP蛋白基因,家族成員間理化特性差異不大,均屬于不穩(wěn)定親水性蛋白,且均含有保守基序;進(jìn)化樹(shù)分析中木豆和擬南芥二者的OFP蛋白相互交錯(cuò)聚類(lèi)在一起,親緣關(guān)系較近的OFP蛋白可能具有相似的功能;啟動(dòng)子順式響應(yīng)元件分析表明木豆OFP基因可能在逆境脅迫響應(yīng)、激素調(diào)節(jié)和生長(zhǎng)發(fā)育方面發(fā)揮重要作用;蛋白二級(jí)和三級(jí)結(jié)構(gòu)均以α-螺旋和無(wú)規(guī)則卷曲結(jié)構(gòu)為主要組成成分;組織特異性表達(dá)表明OFP基因在頂芽中的表達(dá)量較大,在根和葉中的表達(dá)量較小,具有組織表達(dá)差異;啟動(dòng)子順式響應(yīng)元件結(jié)合熱脅迫表達(dá)分析表明,高溫脅迫下CcOFP1表達(dá)量上調(diào),CcOFP9、CcOFP11表達(dá)量下調(diào)。(剩余12497字)

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