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柑橘NHX基因的鑒定及鹽脅迫下表達(dá)分析

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摘要:為研究柑橘NHX基因家族的生物學(xué)特性,利用生物信息學(xué)方法從枳全基因組數(shù)據(jù)庫(kù)篩選出8個(gè)NHX基因,并對(duì)其基因結(jié)構(gòu)、亞細(xì)胞定位、保守序列、啟動(dòng)子順勢(shì)作用元件、共線性、進(jìn)化關(guān)系以及在枳和酸橙中的表達(dá)特征進(jìn)行分析。結(jié)果表明,8個(gè)PtNHXs基因分布在6條染色體上,進(jìn)化關(guān)系上可以分為3個(gè)亞族,編碼的蛋白質(zhì)氨基酸數(shù)為250~1 128 aa,分子量為27.64~125.20 ku,等電點(diǎn)為5.11~9.36,親水系數(shù)為0.022~0.797,均為疏水性蛋白。(剩余14049字)

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