巴西橡膠樹HbPP2基因家族鑒定與表達(dá)分析

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摘  要：橡膠樹膠乳代謝過(guò)程受到多種機(jī)制調(diào)控，其中泛素化修飾調(diào)控最為顯著。韌皮部蛋白PP2屬于F-box蛋白家族，在膠乳中特異性高表達(dá)，可能參與了膠乳再生調(diào)控。本研究對(duì)巴西橡膠樹基因組中鑒定到的17個(gè)F-box成員HbPP2基因進(jìn)行生物信息學(xué)和表達(dá)模式分析，結(jié)果表明：橡膠樹PP2基因編碼的蛋白大多數(shù)為不穩(wěn)定親水性蛋白，分子量介于9.402～61.206 kDa之間；系統(tǒng)進(jìn)化分析表明巴西橡膠樹中的17個(gè)HbPP2基因可以分為3個(gè)亞組（Ⅰ亞組，Ⅱ亞組和Ⅲ亞組），其中HbPP2成員在Ⅰ亞組中完全缺失；順式作用元件分析發(fā)現(xiàn)，PP2基因啟動(dòng)子區(qū)域包含生長(zhǎng)發(fā)育調(diào)控、激素響應(yīng)和光響應(yīng)等多種順勢(shì)作用元件；亞細(xì)胞定位預(yù)測(cè)發(fā)現(xiàn)，PP2蛋白主要定位在葉綠體或細(xì)胞質(zhì)中；表達(dá)分析顯示，橡膠樹HbPP2家族中除部分成員具有組織表達(dá)特異性外，多數(shù)成員在各個(gè)組織中均有表達(dá)，在膠乳中，HbPP2-B1、HbPP2-B1.1、HbPP2-B10.1、HbPP2-A13.2、HbPP2-B13和HbPP2-A15.1的表達(dá)豐度較高，但割膠處理只顯著上調(diào)HbPP2-A13.2和HbPP2-B13的表達(dá)。（剩余18259字）